Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL13AP3Q6NVV1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms