Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC30Q5VVM6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC30Q5VVM6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC30Q5VVM6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms