Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP47Q5SQN1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP47Q5SQN1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms