Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR2Q2VWA4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKOR2Q2VWA4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR2Q2VWA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms