Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CA9Q16790 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA9Q16790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA9Q16790 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA9Q16790 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA9Q16790 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA9Q16790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA9Q16790 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA9Q16790 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CA9Q16790 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA9Q16790 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA9Q16790 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA9Q16790 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA9Q16790 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA9Q16790 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA9Q16790 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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