Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8Q15843 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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