Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL19A1Q14993 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL19A1Q14993 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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