Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD1Q02809 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms