Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MPP1Q00013 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MPP1Q00013 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms