Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM33P57088 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM33P57088 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM33P57088 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM33P57088 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM33P57088 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM33P57088 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms