Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPB1P53618 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB1P53618 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB1P53618 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB1P53618 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB1P53618 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPB1P53618 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPB1P53618 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.7 ms