Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP11P51784 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP11P51784 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP11P51784 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP11P51784 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP11P51784 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP11P51784 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP11P51784 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP11P51784 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms