Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA4P22748 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA4P22748 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA4P22748 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CA4P22748 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA4P22748 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA4P22748 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA4P22748 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CA4P22748 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA4P22748 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA4P22748 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA4P22748 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA4P22748 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA4P22748 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA4P22748 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA4P22748 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA4P22748 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA4P22748 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA4P22748 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA4P22748 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA4P22748 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms