Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPS4Y1P22090 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4Y1P22090 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms