Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARBP10826 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARBP10826 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARBP10826 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARBP10826 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARBP10826 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARBP10826 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARBP10826 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARBP10826 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARBP10826 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARBP10826 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARBP10826 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARBP10826 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARBP10826 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARBP10826 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARBP10826 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms