Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPM3P06753 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPM3P06753 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPM3P06753 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM3P06753 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM3P06753 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM3P06753 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM3P06753 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM3P06753 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM3P06753 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM3P06753 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM3P06753 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM3P06753 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM3P06753 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms