Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3P05106 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB3P05106 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms