Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQL4O94761 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 543.8 ms