Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A3O75365 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A3O75365 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms