Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX1O43812 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX1O43812 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX1O43812 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX1O43812 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX1O43812 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX1O43812 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX1O43812 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX1O43812 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX1O43812 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX1O43812 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX1O43812 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX1O43812 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms