Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASA4O43374 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASA4O43374 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASA4O43374 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASA4O43374 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASA4O43374 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASA4O43374 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASA4O43374 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASA4O43374 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASA4O43374 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASA4O43374 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASA4O43374 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASA4O43374 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RASA4O43374 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASA4O43374 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASA4O43374 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASA4O43374 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms