Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUSKO15146 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MUSKO15146 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUSKO15146 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUSKO15146 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUSKO15146 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUSKO15146 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUSKO15146 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUSKO15146 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUSKO15146 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MUSKO15146 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUSKO15146 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUSKO15146 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUSKO15146 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUSKO15146 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MUSKO15146 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms