Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms