Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM3A6NDB9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms