Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms