Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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