Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UTP11Q9Y3A2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms