Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms