Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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