Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms