Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM167BQ9NRX6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM167BQ9NRX6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms