Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCLRE1BQ9H816 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms