Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN2Q9H4D0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms