Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIPK3Q9H422 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK3Q9H422 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms