Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHCBP1LQ9BZQ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms