Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN1Q9BY11 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms