Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms