Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms