Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLF1Q9BQI6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms