Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms