Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms