Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF19Q96DZ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms