Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A4Q6P5W5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms