Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX2Q3B8N5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms