Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms