Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CA9Q16790 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA9Q16790 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA9Q16790 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA9Q16790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA9Q16790 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA9Q16790 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA9Q16790 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA9Q16790 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA9Q16790 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA9Q16790 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA9Q16790 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA9Q16790 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA9Q16790 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA9Q16790 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA9Q16790 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA9Q16790 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA9Q16790 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA9Q16790 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA9Q16790 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA9Q16790 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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