Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTF1Q16619 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms