Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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