Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARB2Q14108 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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