Protein–RNA interactions for Protein: Q09MP3

RAD51AP2, RAD51-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51AP2Q09MP3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51AP2Q09MP3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51AP2Q09MP3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51AP2Q09MP3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms